Kaip medžiagos, galinčios konkrečiai įsikišti į biomolekulių veiklą, inhibitorių sudėtis tiesiogiai lemia jų veikimo mechanizmą, selektyvumą ir pritaikymą. Nuo cheminės struktūros iki kilmės pagrindiniai inhibitorių komponentai pasižymi didele įvairove, apimančiais natūraliai išgautus mažų molekulių junginius, taip pat dirbtinai susintetintas struktūrizuotas molekules ir bioinžinerinius darinius. Gilus jų pagrindinių komponentų charakteristikų supratimas padeda pasiekti tikslesnį tikslinį reguliavimą atliekant tyrimus ir taikant.
Dauguma natūraliai gaunamų inhibitorių yra antriniai metabolitai, dažniausiai randami augaluose, mikroorganizmuose ir jūrų organizmuose. Šie komponentai dažnai turi sudėtingus heterociklinius, terpeninius, alkaloidinius arba polifenolinius skeletus, kurių stereokonfigūracijos ir funkcinių grupių išdėstymas buvo optimizuotas natūralios evoliucijos būdu, leidžiant jiems dideliu afinitetu prisijungti prie specifinių taikinių. Pavyzdžiui, kai kuriuose augalinės-inhibitoriuose yra fenolio hidroksilo grupių ir aromatinių žiedų sistemų, kurios gali įsiterpti į aktyviąją fermento vietą per vandenilinę jungtį ir hidrofobinę sąveiką; tam tikri poliketidų junginiai, kuriuos gamina aktinomicetai, steriškai trukdo receptorių funkcijai per makrociklinį laktoną arba laktono struktūras. Natūralių inhibitorių pranašumai slypi naujose struktūrose ir unikaliuose veikimo būduose, tačiau jų grynumas ir stabilumas nuo -partijos iki -partijos dažnai yra ribojamas ekstrahavimo ir atskyrimo procesų.
Sintetiniai inhibitoriai ruošiami cheminės sintezės būdais, o jų sudėties dizainą galima racionaliai optimizuoti remiantis tiksline struktūrine informacija. Įprasti skeletai yra benzensulfonamidai, piridino karboksamidai, chinazolinai ir pirimidino dariniai. Fluoras, chloras, nitro arba amino pakaitalai dažnai įvedami į molekules, siekiant padidinti lipofiliškumą, reguliuoti pKa arba pagerinti metabolinį stabilumą. Sintetinio kelio valdymas leidžia tiksliai reguliuoti komponento struktūrą atominiu lygmeniu ir taip pasiekti didesnį selektyvumą ir atkuriamumą, o tai ypač svarbu atliekant klinikinius tyrimus ir didelio našumo atranką, kuriai reikalinga griežta dozavimo kontrolė.
Bioinžinerijos inhibitoriai iš esmės yra biomolekulės arba mažų molekulių pirmtakai, optimizuoti genų inžinerijos arba baltymų inžinerijos metodais. Pavyzdžiui, perprogramavus mikrobų medžiagų apykaitos kelius gali padidėti specifinių natūralių inhibitorių išeiga arba pasikeisti jų šoninės{1}}grandinės struktūros; nukreipta evoliucija taip pat gali duoti mutantinius fermentus, kurie katalizuoja inhibitorių skeletų su naujomis funkcinėmis grupėmis sintezę. Šie komponentai dažnai derina natūralių produktų struktūrinius privalumus su sintetinių molekulių, pasižyminčių geru prisitaikymu sudėtingame tiksliniame reguliavime, pritaikomumu.
Nepriklausomai nuo jų kilmės, pagrindiniai inhibitorių komponentai turi atitikti pagrindinį specifinio prisijungimo prie taikinio reikalavimą, išlikdami stabilūs ir tirpūs jų naudojimo aplinkoje. Pagrindinės komponento funkcinės grupės nustato jo atpažinimo būdą ir slopinimo tipą; pavyzdžiui, karboksilo grupės dalyvauja metalo jonų chelatavime, sulfonamidų grupės sustiprina vandenilio jungčių tinklus, o halogeno atomai padidina membranos pralaidumą. Gilesnis šių struktūrinių elementų supratimas ne tik padeda paaiškinti inhibitorių aktyvumo skirtumus, bet ir suteikia teorinį pagrindą struktūriniam optimizavimui ir naujų inhibitorių kūrimui.
Apskritai pagrindinius inhibitorių komponentus formuoja cheminės struktūros, šaltinio savybių ir funkcinių reikalavimų derinys. Tobulėjant analizės technikoms ir sintetiniams metodams, komponentų projektavimo laisvė ir tikslumas toliau gerėja, atveriant platesnes tikslios molekulinės intervencijos perspektyvas.